Horri guztiari esker, sistema osoan erkidego biologikoak sortu dira, Bilbo barrualdetik Abraraino, eta finkatutako 60 arrain espezie baino gehiago dago (mihi-arraina, kabuxinoa, muxarra, platuxa, korkoina, lupia, barbarina, txitxarroa, aingira…), eta baita sedimentuetan eta harkaitzezko substratuetan bizi diren ehunka animalia eta alga espezie ere.>
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Todo esto ha permitido la presencia de comunidades biológicas en todo el sistema, desde la zona interior de Bilbao hasta el Abra, con más de 60 especies de peces asentadas (lenguado, cabuxino, mojarra, platija, muble, lubina, salmonete, chicharro, anguila…), así como cientos de especies de animales y algas que viven en los sedimentos y en los sustratos rocosos.
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