Estatutuaren indarreangotasunetik eta Agirreren Jaurlaritzaren eraketa unetik aurrera, Euskadin Guda Zibilaren nondik norakoa errotik aldatu zen, bai orden eta moderaziorantzko aldaketa emateagatik eta baita bote politikoa eskuz aldatu izanagatik ere: nagusitasuna Defentsa Batzordeetatik, desagertu egin baitziren, Euzko Jaurlaritzaren esku jarri ziren, Frente Popularretik E.A.J.-ra. Egiatan, alderdi honek Lehendakaritza eta benetako Ministerioak ziren Sailik garrantzitsuenak eskuratu zituen: Defentsa (Agirrek ere), Justizia eta Kultura (Jesus Maria Leizaola), Gobernazioa (Telesforo Monzón) eta Ogasuna (Heliodoro de la Torre).>
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A partir de la vigencia del Estatuto y la formación del Gobierno de Aguirre, el curso de la Guerra Civil en Euskadi se modificó de forma sustancial, tanto por darse un viraje hacia el orden y la moderación como por cambiar de manos el poder político: la hegemonía pasó de las Juntas de Defensa, que desaparecieron, al Gobierno vasco, del Frente Popular al P.N.V. En efecto, este partido ostentó la Presidencia y las principales Consejerías, que eran auténticos Ministerios: Defensa (también Aguirre), Justicia y Cultura (Jesús María Leizaola), Gobernación (Telesforo Monzón) y Hacienda (Heliodoro de la Torre).
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